辽河干流内蒙古段治理工程在我区涉及西辽河治理工程和三江口省界堤防治理工程。2013年8月16日，自治区发展改革委和水利厅以内发改农字〔2013〕1784--1798号文件批复西辽河治理工程初步设计；2013年9月5日，自治区发展改革委和水利厅以内发改农字〔2013〕1950--1953号文件批复三江口省界堤防治理工程（东辽河段）初步设计；2016年4月1日，自治区水利厅以内水建〔2016〕45号文件批复三江口省界堤防治理工程（西辽河段）初步设计。工程设计批复总投资6.21亿元，其中西辽河治理工程4.19亿元、三江口省界堤防治理工程2.01亿元，主要建设内容为加固堤防263.1公里、护岸工程54km，河道疏浚19km。

工程于2014年初开工建设，2011—2017年累计下达投资6.19亿元。目前，累计完成投资5.99亿元，投资计划完成率96.7%。完成的主要建设内容为加固堤防259.2公里、护岸工程51.2km，河道疏浚19km。